Pakiet: python3-biopython (1.85+dfsg-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: python-biopython  ]

Python3 library for bioinformatics

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python3 libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

Inne pakiety związane z python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, m68k]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: python3 [nie hppa]

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13) [alpha, ppc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [nie alpha, hppa, ppc64, sparc64, x32]

  dep: python3 (<< 3.5) [hppa]

  dep: python3 (<< 3.7) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [alpha, m68k, ppc64, sh4]

  dep: python3 (>= 3.13~) [nie alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.4~) [hppa]

  dep: python3 (>= 3.5~) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy [nie alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [x32]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, m68k, ppc64, sh4]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]

• dep: python3-numpy-abi9 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [nie alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

  lub python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-reportlab [hppa, sparc64, x32]

  ReportLab library to create PDF documents using Python3

  dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~) [nie hppa, sparc64, x32]

• dep: w3c-sgml-lib [nie hppa, sparc64, x32]

  w3.org DTD and catalog files

• rec: ncbi-blast+ [nie alpha, x32]

  next generation suite of BLAST sequence search tools

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.0-3) [x32]

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3) [alpha]

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]

  Documentation for the Biopython library

  rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.78+dfsg-2) [x32]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-4) [alpha]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-5) [ppc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.84+dfsg-4) [m68k, sh4]

  rec: python-biopython-doc (= 1.85+dfsg-2) [nie alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

• sug: bwa [nie hppa, sparc64]

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty

• sug: dssp

  Ustalanie drugorzędowej struktury białek na podstawie struktury 3D

• sug: emboss

  European molecular biology open software suite

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle [hppa, sparc64, x32]

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: muscle3 [nie hppa, sparc64, x32]

  multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip [nie hppa]

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python-mysqldb [hppa, sparc64]

  Pakiet niedostępny

• sug: python-reportlab [hppa, sparc64]

  Pakiet niedostępny

• sug: python3-igraph [nie alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  High performance graph data structures and algorithms (Python 3)

• sug: python3-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python3-mmtf [nie hppa, sparc64]

  binary encoding of biological structures (Python 3)

• sug: python3-mysqldb [nie hppa, sparc64]

  Python interface to MySQL

• sug: python3-pil

  Biblioteka obrazowania w Pythonie (Python 3)

• sug: python3-psycopg2

  Python 3 module for PostgreSQL

• sug: python3-rdflib [nie hppa]

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

  sug: python3-rdflib (>= 4) [hppa]

• sug: python3-renderpm [hppa, sparc64, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-reportlab

• sug: python3-scipy [nie hppa]

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x

• sug: raxml

  Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

• sug: w3-dtd-mathml [x32]

  Pakiet niedostępny

• sug: wise [nie hppa, sparc64]

  comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

  sug: wise (>= 2.4.1-16) [hppa, sparc64]

Pobieranie python3-biopython

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.83+dfsg1-4	1 562,6 KiB	11 838,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.85+dfsg-2+b1	1 633,1 KiB	11 833,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.85+dfsg-2+b1	1 618,3 KiB	12 292,0 KiB	[lista plików]
armel	1.85+dfsg-2+b1	1 621,9 KiB	12 341,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.85+dfsg-2+b1	1 606,0 KiB	12 149,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.65+dfsg-1	1 119,5 KiB	7 788,0 KiB	[lista plików]
i386	1.85+dfsg-2+b1	1 628,6 KiB	11 818,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.84+dfsg-4	1 586,6 KiB	11 926,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.85+dfsg-2+b1	1 619,2 KiB	12 304,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.83+dfsg1-5	1 582,7 KiB	11 837,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.85+dfsg-2+b1	1 650,4 KiB	12 356,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.85+dfsg-2+b1	1 630,8 KiB	11 706,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.85+dfsg-2+b1	1 651,7 KiB	11 830,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.84+dfsg-4+b1	1 623,4 KiB	13 017,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.70+dfsg-2	1 139,3 KiB	8 250,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.78+dfsg-2	1 365,8 KiB	9 193,0 KiB	[lista plików]