Package: porechop (0.2.4+dfsg-6 and others)

[ Source: porechop  ]

Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger

Porechop er et værktøj til at finde og fjerne adaptere fra Oxford Nanopore-læsninger. Adaptere i slutningen af læsninger trimmes væk, og når en læsning har en adapter i midten opfattes det som kimærisk og skæres op i separate læsninger. Porechop udfører omhyggelige sammenligninger for effektivt at finde adaptere, selv ved lav sekvensidentitet. Porechop understøtter også demultiplexing af Nanopore-læsninger, der fik stregkode med Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit eller Rapid Barcoding Kit.

Other Packages Related to porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (>= 3~)

Download porechop

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	54.6 kB	290.0 kB	[list of files]
amd64	0.2.4+dfsg-6	55.9 kB	238.0 kB	[list of files]
arm64	0.2.4+dfsg-6+b1	53.2 kB	227.0 kB	[list of files]
armel	0.2.4+dfsg-6	51.0 kB	221.0 kB	[list of files]
armhf	0.2.4+dfsg-6	51.2 kB	205.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	55.4 kB	230.0 kB	[list of files]
i386	0.2.4+dfsg-6	56.9 kB	237.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.2.4+dfsg-5	61.8 kB	290.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	53.0 kB	225.0 kB	[list of files]
mips64el	0.2.4+dfsg-6	52.9 kB	231.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	57.8 kB	291.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.2.4+dfsg-6	58.2 kB	290.0 kB	[list of files]
riscv64	0.2.4+dfsg-6	55.6 kB	218.0 kB	[list of files]
s390x	0.2.4+dfsg-6	57.7 kB	242.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	58.6 kB	225.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	51.3 kB	1,188.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.2.4+dfsg-6	55.4 kB	233.0 kB	[list of files]