Package: porechop (0.2.4+dfsg-4)

[ Source: porechop  ]

Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger

Porechop er et værktøj til at finde og fjerne adaptere fra Oxford Nanopore-læsninger. Adaptere i slutningen af læsninger trimmes væk, og når en læsning har en adapter i midten opfattes det som kimærisk og skæres op i separate læsninger. Porechop udfører omhyggelige sammenligninger for effektivt at finde adaptere, selv ved lav sekvensidentitet. Porechop understøtter også demultiplexing af Nanopore-læsninger, der fik stregkode med Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit eller Rapid Barcoding Kit.

Other Packages Related to porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Download porechop

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	54.3 kB	234.0 kB	[list of files]
arm64	51.7 kB	226.0 kB	[list of files]
armel	50.0 kB	225.0 kB	[list of files]
armhf	50.3 kB	225.0 kB	[list of files]
i386	54.8 kB	229.0 kB	[list of files]
mips64el	51.9 kB	226.0 kB	[list of files]
mipsel	51.5 kB	224.0 kB	[list of files]
ppc64el	56.8 kB	290.0 kB	[list of files]
s390x	52.5 kB	230.0 kB	[list of files]