Package: porechop (0.2.4+dfsg-1)

[ Source: porechop  ]

Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger

Porechop er et værktøj til at finde og fjerne adaptere fra Oxford Nanopore-læsninger. Adaptere i slutningen af læsninger trimmes væk, og når en læsning har en adapter i midten opfattes det som kimærisk og skæres op i separate læsninger. Porechop udfører omhyggelige sammenligninger for effektivt at finde adaptere, selv ved lav sekvensidentitet. Porechop understøtter også demultiplexing af Nanopore-læsninger, der fik stregkode med Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit eller Rapid Barcoding Kit.

Other Packages Related to porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af python3

  dep: python3 (>= 3~)

Download porechop

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	54.7 kB	237.0 kB	[list of files]
arm64	52.1 kB	225.0 kB	[list of files]
armhf	50.6 kB	208.0 kB	[list of files]
i386	55.9 kB	236.0 kB	[list of files]