Пакет: porechop (0.2.4+dfsg-6 и други)

[ Източник: porechop  ]

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Други пакети, свързани с porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Изтегляне на porechop

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	54,6 кБ	290,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.2.4+dfsg-6	55,9 кБ	238,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.2.4+dfsg-6+b1	53,2 кБ	227,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.2.4+dfsg-6	51,0 кБ	221,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.2.4+dfsg-6	51,2 кБ	205,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	55,4 кБ	230,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.2.4+dfsg-6	56,9 кБ	237,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-5	61,8 кБ	290,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	53,0 кБ	225,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.2.4+dfsg-6	52,9 кБ	231,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	57,8 кБ	291,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.2.4+dfsg-6	58,2 кБ	290,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.2.4+dfsg-6	55,6 кБ	218,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.2.4+dfsg-6	57,7 кБ	242,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	58,6 кБ	225,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	51,3 кБ	1 188,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.2.4+dfsg-6	55,4 кБ	233,0 кБ	[списък на файловете]