Package: porechop (0.2.4+dfsg-6 and others)

[ Source: porechop  ]

Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger

Porechop er et værktøj til at finde og fjerne adaptere fra Oxford Nanopore-læsninger. Adaptere i slutningen af læsninger trimmes væk, og når en læsning har en adapter i midten opfattes det som kimærisk og skæres op i separate læsninger. Porechop udfører omhyggelige sammenligninger for effektivt at finde adaptere, selv ved lav sekvensidentitet. Porechop understøtter også demultiplexing af Nanopore-læsninger, der fik stregkode med Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit eller Rapid Barcoding Kit.

Other Packages Related to porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (>= 3~)

Download porechop

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.2.4+dfsg-6	55.9 kB	238.0 kB	[list of files]
arm64	0.2.4+dfsg-6+b1	53.2 kB	227.0 kB	[list of files]
armel	0.2.4+dfsg-6	51.0 kB	221.0 kB	[list of files]
armhf	0.2.4+dfsg-6	51.2 kB	205.0 kB	[list of files]
i386	0.2.4+dfsg-6	56.9 kB	237.0 kB	[list of files]
mips64el	0.2.4+dfsg-6	52.9 kB	231.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.2.4+dfsg-6	58.2 kB	290.0 kB	[list of files]
riscv64	0.2.4+dfsg-6	55.6 kB	218.0 kB	[list of files]
s390x	0.2.4+dfsg-6	57.7 kB	242.0 kB	[list of files]