Пакет: porechop (0.2.4+dfsg-6 и другие)

[ Источник: porechop  ]

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Другие пакеты, относящиеся к porechop

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (>= 3~)

Загрузка porechop

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	54,6 Кб	290,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.2.4+dfsg-6	55,9 Кб	238,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.2.4+dfsg-6+b1	53,2 Кб	227,0 Кб	[список файлов]
armel	0.2.4+dfsg-6	51,0 Кб	221,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.2.4+dfsg-6	51,2 Кб	205,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	55,4 Кб	230,0 Кб	[список файлов]
i386	0.2.4+dfsg-6	56,9 Кб	237,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-5	61,8 Кб	290,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	53,0 Кб	225,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.2.4+dfsg-6	52,9 Кб	231,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	57,8 Кб	291,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.2.4+dfsg-6	58,2 Кб	290,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.2.4+dfsg-6	55,6 Кб	218,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.2.4+dfsg-6	57,7 Кб	242,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	58,6 Кб	225,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	51,3 Кб	1 188,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.2.4+dfsg-6	55,4 Кб	233,0 Кб	[список файлов]