[ Source: skewer ]
Package: skewer (0.2.2-2)
Links for skewer
Debian Resources:
Download Source Package skewer:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger
Skewer implementerer den bit-maskede k-forskels matchende algoritme dedikeret til opgaven med adapter-tilpasning og den er specielt designet til at behandle næstegenerations sekventering (NGS) paired-end sekvenser.
Funktioner
* Registrering og fjernelse af adaptersekvenser * Indsættelse og sletning tilladt i mønstermatchning * Målrettet læsningerne Single End, Paired End (PE) og Long Mate Pair (LMP) * Demultiplexing af stregkodede sekventeringsafviklinger * Tilpasning baseret på phred-kvalitetsbedømmelser * IUPAC-tegn for stregkoder og adaptere * Komprimeret understøttelse for inddata og uddata
Other Packages Related to skewer
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
Download skewer
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 68.2 kB | 198.0 kB | [list of files] |
arm64 | 59.4 kB | 166.0 kB | [list of files] |
armel | 58.8 kB | 174.0 kB | [list of files] |
armhf | 60.4 kB | 130.0 kB | [list of files] |
i386 | 71.0 kB | 214.0 kB | [list of files] |
mips64el | 63.4 kB | 212.0 kB | [list of files] |
mipsel | 65.1 kB | 206.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 65.9 kB | 211.0 kB | [list of files] |
s390x | 60.9 kB | 194.0 kB | [list of files] |