[ Source: skewer ]
Paketti: skewer (0.2.2-2)
Links for skewer
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti skewer:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.
Features
* Detection and removal of adapter sequences * Insertion and deletion allowed in pattern matching * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads * Demultiplexing of barcoded sequencing runs * Multi-threading support * Trimming based on phred quality scores * IUPAC characters for barcodes and adapters * Compressed input and output support
Muut pakettiin skewer liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
Imuroi skewer
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 68.2 kt | 198.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 59.4 kt | 166.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 58.8 kt | 174.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 60.4 kt | 130.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 71.0 kt | 214.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 63.4 kt | 212.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 65.1 kt | 206.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 65.9 kt | 211.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 60.9 kt | 194.0 kt | [tiedostoluettelo] |