[ Pakiet źródłowy: skewer ]
Pakiet: skewer (0.2.2-2)
Odnośniki dla skewer
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego skewer:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.
Features
* Detection and removal of adapter sequences * Insertion and deletion allowed in pattern matching * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads * Demultiplexing of barcoded sequencing runs * Multi-threading support * Trimming based on phred quality scores * IUPAC characters for barcodes and adapters * Compressed input and output support
Inne pakiety związane z skewer
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]
- Biblioteka wspomagająca GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
Pobieranie skewer
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
amd64 | 68,2 KiB | 198,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 59,4 KiB | 166,0 KiB | [lista plików] |
armel | 58,8 KiB | 174,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 60,4 KiB | 130,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 71,0 KiB | 214,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 63,4 KiB | 212,0 KiB | [lista plików] |
mipsel | 65,1 KiB | 206,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 65,9 KiB | 211,0 KiB | [lista plików] |
s390x | 60,9 KiB | 194,0 KiB | [lista plików] |