Package: skewer (0.2.2-6 and others)

[ Source: skewer  ]

Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger

Skewer implementerer den bit-maskede k-forskels matchende algoritme dedikeret til opgaven med adapter-tilpasning og den er specielt designet til at behandle næstegenerations sekventering (NGS) paired-end sekvenser.

Funktioner

 * Registrering og fjernelse af adaptersekvenser
 * Indsættelse og sletning tilladt i mønstermatchning
 * Målrettet læsningerne Single End, Paired End (PE) og Long Mate
   Pair (LMP)
 * Demultiplexing af stregkodede sekventeringsafviklinger
 * Tilpasning baseret på phred-kvalitetsbedømmelser
 * IUPAC-tegn for stregkoder og adaptere
 * Komprimeret understøttelse for inddata og uddata

Other Packages Related to skewer

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download skewer

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.2.2-6+b1	86.4 kB	216.0 kB	[list of files]
arm64	0.2.2-6+b1	76.4 kB	235.0 kB	[list of files]
armel	0.2.2-6+b1	75.2 kB	235.0 kB	[list of files]
armhf	0.2.2-6+b1	75.5 kB	171.0 kB	[list of files]
i386	0.2.2-6+b1	90.2 kB	231.0 kB	[list of files]
mips64el	0.2.2-6+b1	81.5 kB	242.0 kB	[list of files]
mipsel	0.2.2-6+b1	83.1 kB	240.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84.9 kB	236.0 kB	[list of files]
s390x	0.2.2-6+b1	76.0 kB	199.0 kB	[list of files]