Пакет: vt (0.57721+ds-3)

[ Източник: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Други пакети, свързани с vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

Изтегляне на vt

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	756,2 кБ	2 565,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	624,3 кБ	2 241,0 кБ	[списък на файловете]
armel	604,2 кБ	2 152,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	624,4 кБ	1 524,0 кБ	[списък на файловете]
i386	763,0 кБ	2 776,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	576,1 кБ	3 225,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	580,6 кБ	2 977,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	693,5 кБ	2 833,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	638,5 кБ	2 533,0 кБ	[списък на файловете]