套件：r-bioc-edger（4.2.2+dfsg-1 以及其他的）

[ 原始碼： r-bioc-edger  ]

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 實做語言: implemented-in::r, interface::commandline, 角色: 程式

其他與 r-bioc-edger 有關的套件

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  或者 libblas.so.3

  本虛擬套件由這些套件填實： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [除 alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  或者 liblapack.so.3

  本虛擬套件由這些套件填實： libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [除 hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-4.0

  本虛擬套件由這些套件填實： r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  套件暫時不可用

• dep: r-api-bioc-3.19 [除 hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  本虛擬套件由這些套件填實： r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5) [除 alpha]

  linear models for microarray data

  dep: r-bioc-limma (>= 3.60.3) [alpha]

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-annotationdbi [除 alpha]

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

  sug: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0) [alpha]

• sug: r-bioc-biobase [除 alpha]

  base functions for Bioconductor

  sug: r-bioc-biobase (>= 2.64.0) [alpha]

• sug: r-bioc-biocstyle [除 alpha]

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

  sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1) [alpha]

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db [除 alpha]

  genome-wide annotation for Human

  sug: r-bioc-org.hs.eg.db (>= 3.19.1) [alpha]

• sug: r-bioc-rhdf5 [除 alpha]

  BioConductor HDF5 interface to R

  sug: r-bioc-rhdf5 (>= 2.48.0) [alpha]

• sug: r-bioc-summarizedexperiment [除 alpha]

  BioConductor assay container

  sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0) [alpha]

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-seuratobject

  GNU R data structures for single cell data

下載 r-bioc-edger

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	4.2.1+dfsg-1	1，140。3 kB	1，588。0 kB	[檔案列表]
amd64	4.2.2+dfsg-1	1，154。4 kB	1，520。0 kB	[檔案列表]
arm64	4.2.2+dfsg-1	1，137。6 kB	1，524。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	4.0.16+dfsg-1	1，113。3 kB	1，522。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	4.0.16+dfsg-1	1，136。4 kB	1，806。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	4.0.16+dfsg-1	1，100。6 kB	1，432。0 kB	[檔案列表]
mips64el	4.2.2+dfsg-1	1，130。0 kB	1，625。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	4.2.2+dfsg-1	1，155。9 kB	1，654。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	4.2.2+dfsg-1	1，152。9 kB	1，588。0 kB	[檔案列表]
riscv64	4.2.2+dfsg-1	1，153。3 kB	1，459。0 kB	[檔案列表]
s390x	4.2.2+dfsg-1	1，153。3 kB	1，524。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	4.0.16+dfsg-1	1，129。7 kB	1，493。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	4.2.2+dfsg-1	1，126。9 kB	2，234。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	4.0.16+dfsg-1	1，119。8 kB	1，451。0 kB	[檔案列表]