Пакунок: r-bioc-edger (4.4.2+dfsg-1 and others)

[ Source: r-bioc-edger  ]

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::r, interface::commandline, Role: Program

Інші пакунки пов'язані з r-bioc-edger

• dep: libblas3

  Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [not alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: liblapack3

  Бібліотека підпрограм лінійної алгебри вер. 3 — колективна версія

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Пакунок недоступний

• dep: r-api-bioc-3.20 [not hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  linear models for microarray data

  dep: r-bioc-limma (>= 3.61.9) [not hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-rcpp [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  genome-wide annotation for Human

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-seuratobject

  GNU R data structures for single cell data

Завантажити r-bioc-edger

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	4.4.1+dfsg-2	1,090.0 kB	1,332.0 kB	[список файлів]
amd64	4.4.2+dfsg-1	1,091.9 kB	1,315.0 kB	[список файлів]
arm64	4.4.2+dfsg-1	1,089.2 kB	1,331.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	4.0.16+dfsg-1	1,113.3 kB	1,522.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	4.0.16+dfsg-1	1,136.4 kB	1,806.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	4.0.16+dfsg-1	1,100.6 kB	1,432.0 kB	[список файлів]
mips64el	4.4.2+dfsg-1	1,088.1 kB	1,335.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	4.4.2+dfsg-1	1,097.7 kB	1,397.0 kB	[список файлів]
ppc64el	4.4.2+dfsg-1	1,097.0 kB	1,331.0 kB	[список файлів]
riscv64	4.4.2+dfsg-1	1,092.7 kB	1,295.0 kB	[список файлів]
s390x	4.4.2+dfsg-1	1,095.5 kB	1,319.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	4.0.16+dfsg-1	1,129.7 kB	1,493.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	4.4.2+dfsg-1	1,084.8 kB	2,231.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	4.0.16+dfsg-1	1,119.8 kB	1,451.0 kB	[список файлів]