Pacote: r-bioc-edger (4.4.2+dfsg-1 e outros)

[ Fonte: r-bioc-edger  ]

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::r, interface::commandline, Função: Programa

Outros pacotes relacionados a r-bioc-edger

• dep: libblas3

  Implementações de Referências Básicas de Álgebra Linear , Biblioteca compartilhada

  ou libblas.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [não alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: liblapack3

  Biblioteca de rotinas de álgebra linear 3 - versão compartilhada

  ou liblapack.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: r-api-4.0

  pacote virtual fornecido por r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-bioc-3.20 [não hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  pacote virtual fornecido por r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  linear models for microarray data

  dep: r-bioc-limma (>= 3.61.9) [não hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-rcpp [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

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• sug: r-bioc-rhdf5

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• sug: r-bioc-summarizedexperiment

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• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-seuratobject

  GNU R data structures for single cell data

Download de r-bioc-edger

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	4.4.2+dfsg-1	1,091.2 kB	1,331.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	4.4.2+dfsg-1	1,091.9 kB	1,315.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	4.4.2+dfsg-1	1,089.2 kB	1,331.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	4.0.16+dfsg-1	1,113.3 kB	1,522.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	4.0.16+dfsg-1	1,136.4 kB	1,806.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	4.4.2+dfsg-1	1,091.3 kB	1,330.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	4.0.16+dfsg-1	1,100.6 kB	1,432.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	4.4.2+dfsg-1	1,088.1 kB	1,335.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	4.4.2+dfsg-1	1,097.7 kB	1,397.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	4.4.2+dfsg-1	1,097.0 kB	1,331.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	4.4.2+dfsg-1	1,092.7 kB	1,295.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	4.4.2+dfsg-1	1,095.5 kB	1,319.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	4.0.16+dfsg-1	1,129.7 kB	1,493.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	4.4.2+dfsg-1	1,084.8 kB	2,231.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	4.0.16+dfsg-1	1,119.8 kB	1,451.0 kB	[lista de arquivos]