软件包：pizzly（0.37.3+ds-9 以及其他的）

[ 源代码： pizzly  ]

Identifies gene fusions in RNA sequencing data

For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.

Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.

其他与 pizzly 有关的软件包

• dep: kallisto

  near-optimal RNA-Seq quantification

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libstdc++6 (>= 12) [amd64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-12) [ia64, m68k, sparc64]

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9) [alpha, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  压缩库 - 运行时

• rec: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

下载 pizzly

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	271.7 kB	1,059.0 kB	[文件列表]
amd64	0.37.3+ds-9	285.5 kB	864.0 kB	[文件列表]
arm64	0.37.3+ds-9+b1	262.0 kB	865.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	268.7 kB	819.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	342.3 kB	1,558.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	258.3 kB	815.0 kB	[文件列表]
mips64el	0.37.3+ds-9	246.3 kB	962.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	280.6 kB	1,056.0 kB	[文件列表]
ppc64el	0.37.3+ds-9	285.1 kB	992.0 kB	[文件列表]
riscv64	0.37.3+ds-9+b1	285.6 kB	725.0 kB	[文件列表]
s390x	0.37.3+ds-9	249.8 kB	876.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	334.6 kB	864.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	230.4 kB	1,062.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	286.2 kB	815.0 kB	[文件列表]