套件：pizzly（0.37.3+ds-9 以及其他的）

[ 原始碼： pizzly  ]

Identifies gene fusions in RNA sequencing data

For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.

Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.

其他與 pizzly 有關的套件

• dep: kallisto

  near-optimal RNA-Seq quantification

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 12) [amd64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-12) [ia64, m68k, sparc64]

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9) [alpha, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

• rec: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

下載 pizzly

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	271。7 kB	1，059。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.37.3+ds-9	285。5 kB	864。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.37.3+ds-9+b1	262。0 kB	865。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	268。7 kB	819。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	342。3 kB	1，558。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	258。3 kB	815。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.37.3+ds-9	246。3 kB	962。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	280。6 kB	1，056。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.37.3+ds-9	285。1 kB	992。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.37.3+ds-9+b1	285。6 kB	725。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.37.3+ds-9	249。8 kB	876。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	334。6 kB	864。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	230。4 kB	1，062。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.37.3+ds-9	286。2 kB	815。0 kB	[檔案列表]