Paket: python3-mappy (2.27+dfsg-1 och andra)

[ Källkod: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Andra paket besläktade med python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [ej ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta python3-mappy

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1	171,3 kbyte	497,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	2.27+dfsg-1+b1	138,9 kbyte	355,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.27+dfsg-1+b2	136,3 kbyte	367,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.27+dfsg-1+b1	151,8 kbyte	407,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.27+dfsg-1+b1	153,7 kbyte	299,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1+b1	184,3 kbyte	473,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.27+dfsg-1+b1	181,8 kbyte	512,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	2.24+dfsg-3+b1	256,8 kbyte	1.500,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1+b1	149,7 kbyte	419,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.27+dfsg-1+b1	163,3 kbyte	508,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1+b1	176,0 kbyte	559,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b1	159,5 kbyte	495,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.27+dfsg-1+b1	179,1 kbyte	359,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.27+dfsg-1+b1	185,9 kbyte	495,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1	202,4 kbyte	427,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1+b1	153,3 kbyte	1.077,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	2.27+dfsg-1	156,3 kbyte	387,0 kbyte	[filförteckning]