Paketti: python3-mappy (2.27+dfsg-1 ja muut)

[ Source: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Muut pakettiin python3-mappy liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [ei ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, x32]

  dep: python3 (>= 3.13~) [ei ia64, m68k, x32]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi python3-mappy

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b2	174.3 kt	498.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	2.27+dfsg-1+b3	145.6 kt	375.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.27+dfsg-1+b4	139.3 kt	367.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	2.27+dfsg-1+b3	153.9 kt	427.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	2.27+dfsg-1+b3	155.6 kt	363.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b3	184.1 kt	473.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	2.27+dfsg-1+b3	183.1 kt	524.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kt	1,500.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b2	167.8 kt	784.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.27+dfsg-1+b3	167.0 kt	509.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b3	179.8 kt	559.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b3	169.5 kt	495.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.27+dfsg-1+b3	180.7 kt	359.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2.27+dfsg-1+b3	189.7 kt	499.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b2	206.1 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b3	153.9 kt	1,077.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	2.27+dfsg-1+b1	177.9 kt	738.0 kt	[tiedostoluettelo]