Balík: python3-mappy (2.27+dfsg-1 a iné)

[ Zdroj: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [nie ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [nie ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť python3-mappy

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b1	192.1 kB	958.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2.27+dfsg-1+b2	160.8 kB	690.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.27+dfsg-1+b3	154.2 kB	696.0 kB	[zoznam súborov]
armel	2.27+dfsg-1+b2	168.0 kB	778.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2.27+dfsg-1+b2	168.5 kB	562.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b2	197.6 kB	892.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2.27+dfsg-1+b2	200.8 kB	994.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kB	1,500.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b2	167.8 kB	784.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.27+dfsg-1+b2	178.7 kB	978.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b2	195.9 kB	1,080.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b2	181.2 kB	952.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.27+dfsg-1+b2	199.0 kB	664.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.27+dfsg-1+b2	206.8 kB	948.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b1	219.8 kB	818.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b2	164.6 kB	2,116.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.27+dfsg-1+b1	177.9 kB	738.0 kB	[zoznam súborov]