Пакунок: python3-mappy (2.27+dfsg-1 and others)

[ Source: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Інші пакунки пов'язані з python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [not ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити python3-mappy

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2.27+dfsg-1	171.3 kB	497.0 kB	[список файлів]
amd64	2.27+dfsg-1+b1	138.9 kB	355.0 kB	[список файлів]
arm64	2.27+dfsg-1+b2	136.3 kB	367.0 kB	[список файлів]
armel	2.27+dfsg-1+b1	151.8 kB	407.0 kB	[список файлів]
armhf	2.27+dfsg-1+b1	153.7 kB	299.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	184.3 kB	473.0 kB	[список файлів]
i386	2.27+dfsg-1+b1	181.8 kB	512.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kB	1,500.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	149.7 kB	419.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.27+dfsg-1+b1	163.3 kB	508.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	176.0 kB	559.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b1	159.5 kB	495.0 kB	[список файлів]
riscv64	2.27+dfsg-1+b1	179.1 kB	359.0 kB	[список файлів]
s390x	2.27+dfsg-1+b1	185.9 kB	495.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	2.27+dfsg-1	202.4 kB	427.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	153.3 kB	1,077.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	2.27+dfsg-1	156.3 kB	387.0 kB	[список файлів]