все параметры
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Источник: minimap2  ]

Пакет: python3-mappy (2.27+dfsg-1 и другие)

Ссылки для python3-mappy

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код minimap2:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Другие пакеты, относящиеся к python3-mappy

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка python3-mappy

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b2 174,3 Кб498,0 Кб [список файлов]
amd64 2.27+dfsg-1+b3 145,6 Кб375,0 Кб [список файлов]
arm64 2.27+dfsg-1+b4 139,3 Кб367,0 Кб [список файлов]
armel 2.27+dfsg-1+b3 153,9 Кб427,0 Кб [список файлов]
armhf 2.27+dfsg-1+b3 155,6 Кб363,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b3 184,1 Кб473,0 Кб [список файлов]
i386 2.27+dfsg-1+b3 183,1 Кб524,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 2.24+dfsg-3+b1 256,8 Кб1 500,0 Кб [список файлов]
loong64 (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b3 160,3 Кб431,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b2 167,8 Кб784,0 Кб [список файлов]
mips64el 2.27+dfsg-1+b3 167,0 Кб509,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b3 179,8 Кб559,0 Кб [список файлов]
ppc64el 2.27+dfsg-1+b3 169,5 Кб495,0 Кб [список файлов]
riscv64 2.27+dfsg-1+b3 180,7 Кб359,0 Кб [список файлов]
s390x 2.27+dfsg-1+b3 189,7 Кб499,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b2 206,1 Кб428,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b3 153,9 Кб1 077,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 2.27+dfsg-1+b1 177,9 Кб738,0 Кб [список файлов]