Package: python3-mappy (2.27+dfsg-1 and others)

[ Source: minimap2  ]

interfaccia Python 3 per minimap2

Minimap2 è un versatile programma per l'allineamento di sequenze che allinea sequenze di DNA o mRNA rispetto a un grande database di riferimento. Casi d'uso tipici includono: (1) mappatura di letture genomiche PacBio o Oxford Nanopore con il genoma umano; (2) ricerca di sovrapposizioni tra letture lunghe con tassi di errore fino a ~15%; (3) allineamento, tenendo conto degli splice, di letture PacBio Iso-Seq o Nanopore cDNA o Direct RNA rispetto a un genoma di riferimento; (4) allineamento di letture Illumina singole o accoppiate; (5) allineamento assemblaggio-verso-assemblaggio; (6) allineamento dell'intero genoma tra due specie strettamente imparentate con divergenza sotto a ~15%.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Python 3 per usare minimap2.

Other Packages Related to python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [not ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

Download python3-mappy

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.27+dfsg-1	171.3 kB	497.0 kB	[list of files]
amd64	2.27+dfsg-1+b1	138.9 kB	355.0 kB	[list of files]
arm64	2.27+dfsg-1+b2	136.3 kB	367.0 kB	[list of files]
armel	2.27+dfsg-1+b1	151.8 kB	407.0 kB	[list of files]
armhf	2.27+dfsg-1+b1	153.7 kB	299.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	184.3 kB	473.0 kB	[list of files]
i386	2.27+dfsg-1+b1	181.8 kB	512.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kB	1,500.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	149.7 kB	419.0 kB	[list of files]
mips64el	2.27+dfsg-1+b1	163.3 kB	508.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	176.0 kB	559.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b1	159.5 kB	495.0 kB	[list of files]
riscv64	2.27+dfsg-1+b1	179.1 kB	359.0 kB	[list of files]
s390x	2.27+dfsg-1+b1	185.9 kB	495.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.27+dfsg-1	202.4 kB	427.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	153.3 kB	1,077.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.27+dfsg-1	156.3 kB	387.0 kB	[list of files]