Package: python3-mappy (2.27+dfsg-1 and others)

[ Source: minimap2  ]

interfaccia Python 3 per minimap2

Minimap2 è un versatile programma per l'allineamento di sequenze che allinea sequenze di DNA o mRNA rispetto a un grande database di riferimento. Casi d'uso tipici includono: (1) mappatura di letture genomiche PacBio o Oxford Nanopore con il genoma umano; (2) ricerca di sovrapposizioni tra letture lunghe con tassi di errore fino a ~15%; (3) allineamento, tenendo conto degli splice, di letture PacBio Iso-Seq o Nanopore cDNA o Direct RNA rispetto a un genoma di riferimento; (4) allineamento di letture Illumina singole o accoppiate; (5) allineamento assemblaggio-verso-assemblaggio; (6) allineamento dell'intero genoma tra due specie strettamente imparentate con divergenza sotto a ~15%.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Python 3 per usare minimap2.

Other Packages Related to python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [not ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [not ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

Download python3-mappy

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	192.1 kB	958.0 kB	[list of files]
amd64	2.27+dfsg-1+b2	160.8 kB	690.0 kB	[list of files]
arm64	2.27+dfsg-1+b3	154.2 kB	696.0 kB	[list of files]
armel	2.27+dfsg-1+b2	168.0 kB	778.0 kB	[list of files]
armhf	2.27+dfsg-1+b2	168.5 kB	562.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	197.6 kB	892.0 kB	[list of files]
i386	2.27+dfsg-1+b2	200.8 kB	994.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kB	1,500.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	167.8 kB	784.0 kB	[list of files]
mips64el	2.27+dfsg-1+b2	178.7 kB	978.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	195.9 kB	1,080.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b2	181.2 kB	952.0 kB	[list of files]
riscv64	2.27+dfsg-1+b2	199.0 kB	664.0 kB	[list of files]
s390x	2.27+dfsg-1+b2	206.8 kB	948.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	219.8 kB	818.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	164.6 kB	2,116.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	177.9 kB	738.0 kB	[list of files]