Paket: python3-mappy (2.24+dfsg-3 och andra)

[ Källkod: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Andra paket besläktade med python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta python3-mappy

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.24+dfsg-3+b1	130,2 kbyte	330,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.24+dfsg-3+b1	127,2 kbyte	370,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.24+dfsg-3+b1	143,1 kbyte	380,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.24+dfsg-3+b1	144,0 kbyte	280,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.24+dfsg-3+b1	172,8 kbyte	485,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.24+dfsg-3+b1	155,2 kbyte	447,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	2.24+dfsg-3+b1	166,2 kbyte	440,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.24+dfsg-3+b1	150,4 kbyte	434,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.24+dfsg-3+b1	149,5 kbyte	434,0 kbyte	[filförteckning]