Paket: python3-mappy (2.27+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [nicht ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, x32]

  dep: python3 (>= 3.13~) [nicht ia64, m68k, x32]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

python3-mappy herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b2	174,3 kB	498,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.27+dfsg-1+b3	145,6 kB	375,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.27+dfsg-1+b4	139,3 kB	367,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.27+dfsg-1+b3	153,9 kB	427,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.27+dfsg-1+b3	155,6 kB	363,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b3	184,1 kB	473,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.27+dfsg-1+b3	183,1 kB	524,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.24+dfsg-3+b1	256,8 kB	1.500,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b3	160,3 kB	431,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b2	167,8 kB	784,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.27+dfsg-1+b3	167,0 kB	509,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b3	179,8 kB	559,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b3	169,5 kB	495,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.27+dfsg-1+b3	180,7 kB	359,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.27+dfsg-1+b3	189,7 kB	499,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b2	206,1 kB	428,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b3	153,9 kB	1.077,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.27+dfsg-1+b1	177,9 kB	738,0 kB	[Liste der Dateien]