Paket: freebayes (1.3.5-1)

[ Källkod: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Andra paket besläktade med freebayes

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ej armel, armhf]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.2+dfsg)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Hämta freebayes

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.433,4 kbyte	3.949,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.385,5 kbyte	3.805,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.367,9 kbyte	3.789,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.377,7 kbyte	3.417,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.480,3 kbyte	4.153,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.420,4 kbyte	4.291,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	1.444,5 kbyte	4.292,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.452,5 kbyte	4.254,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.366,8 kbyte	4.028,0 kbyte	[filförteckning]