Pakiet: lagan (2.0-6)

[ Pakiet źródłowy: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Inne pakiety związane z lagan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie lagan

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	174,9 KiB	820,0 KiB	[lista plików]
arm64	169,4 KiB	736,0 KiB	[lista plików]
armel	159,7 KiB	665,0 KiB	[lista plików]
armhf	160,2 KiB	565,0 KiB	[lista plików]
i386	183,8 KiB	821,0 KiB	[lista plików]
mips64el	179,1 KiB	832,0 KiB	[lista plików]
mipsel	181,0 KiB	761,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	196,7 KiB	1 888,0 KiB	[lista plików]
s390x	170,7 KiB	784,0 KiB	[lista plików]