Paket: lagan (2.0-6)

[ Quellcode: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere Pakete mit Bezug zu lagan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	174,9 kB	820,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	169,4 kB	736,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	159,7 kB	665,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	160,2 kB	565,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	183,8 kB	821,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	179,1 kB	832,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	181,0 kB	761,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	196,7 kB	1.888,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	170,7 kB	784,0 kB	[Liste der Dateien]