Balík: lagan (2.0-6)

[ Zdroj: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom lagan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť lagan

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	174.9 kB	820.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	169.4 kB	736.0 kB	[zoznam súborov]
armel	159.7 kB	665.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	160.2 kB	565.0 kB	[zoznam súborov]
i386	183.8 kB	821.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	179.1 kB	832.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	181.0 kB	761.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	196.7 kB	1,888.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	170.7 kB	784.0 kB	[zoznam súborov]