Balík: vt (0.57721+ds-3 a iné)

[ Zdroj: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom vt

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie arm64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, riscv64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nová knižnica PCRE - 8-bitová dynamická knižnica

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: r-base-core

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

Stiahnuť vt

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kB	2,902.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702.6 kB	2,706.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kB	2,361.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657.9 kB	1,661.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kB	3,065.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kB	3,505.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kB	3,090.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803.1 kB	2,342.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kB	2,834.0 kB	[zoznam súborov]