Пакет: tantan (51-1 и другие)

[ Источник: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Роль: Программа, Область: scope::utility, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  библиотека сжатия

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Загрузка tantan

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	51-1	38,9 Кб	145,0 Кб	[список файлов]
amd64	51-1	41,3 Кб	120,0 Кб	[список файлов]
arm64	51-1	37,7 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
armel	51-1	36,9 Кб	107,0 Кб	[список файлов]
armhf	51-1	34,9 Кб	79,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	51-1	39,5 Кб	104,0 Кб	[список файлов]
i386	51-1	44,5 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	49-2	51,1 Кб	200,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	51-1	38,7 Кб	112,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	51-1	38,1 Кб	111,0 Кб	[список файлов]
mips64el	51-1	41,2 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	51-1	43,3 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	51-1	43,9 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
riscv64	51-1	40,1 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
s390x	51-1	44,5 Кб	124,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	51-1	47,7 Кб	143,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	51-1	34,5 Кб	1 042,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	51-1	41,7 Кб	115,0 Кб	[список файлов]