Pakiet: tantan (51-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Pobieranie tantan

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	51-1	38,9 KiB	145,0 KiB	[lista plików]
amd64	51-1	41,3 KiB	120,0 KiB	[lista plików]
arm64	51-1	37,7 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
armel	51-1	36,9 KiB	107,0 KiB	[lista plików]
armhf	51-1	34,9 KiB	79,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	51-1	39,5 KiB	104,0 KiB	[lista plików]
i386	51-1	44,5 KiB	119,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	49-2	51,1 KiB	200,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	51-1	38,7 KiB	112,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	51-1	38,1 KiB	111,0 KiB	[lista plików]
mips64el	51-1	41,2 KiB	149,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	51-1	43,3 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	51-1	43,9 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
riscv64	51-1	40,1 KiB	92,0 KiB	[lista plików]
s390x	51-1	44,5 KiB	124,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	51-1	47,7 KiB	143,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	51-1	34,5 KiB	1 042,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	51-1	41,7 KiB	115,0 KiB	[lista plików]