Пакунок: tantan (51-1 and others)

[ Source: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Завантажити tantan

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	51-1	38.9 kB	145.0 kB	[список файлів]
amd64	51-1	41.3 kB	120.0 kB	[список файлів]
arm64	51-1	37.7 kB	144.0 kB	[список файлів]
armel	51-1	36.9 kB	107.0 kB	[список файлів]
armhf	51-1	34.9 kB	79.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	51-1	39.5 kB	104.0 kB	[список файлів]
i386	51-1	44.5 kB	119.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	49-2	51.1 kB	200.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	51-1	38.1 kB	111.0 kB	[список файлів]
mips64el	51-1	41.2 kB	149.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	51-1	43.3 kB	144.0 kB	[список файлів]
ppc64el	51-1	43.9 kB	144.0 kB	[список файлів]
riscv64	51-1	40.1 kB	92.0 kB	[список файлів]
s390x	51-1	44.5 kB	124.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	51-1	47.7 kB	143.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	51-1	34.5 kB	1,042.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	51-1	41.7 kB	115.0 kB	[список файлів]