Paquet : tantan (51-1 et autres)

[ Paquet source : tantan  ]

masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences

Tantan est un outil pour masquer des régions simples (peu complexes et avec peu de répétitions en tandem sur une période courte) dans des séquences d'ADN, d'ARN et de protéines. Le but de tantan est d'empêcher les prédictions fausses lorsqu'on cherche des régions homologues entre deux séquences. Les répétitions simples s'alignent souvent fortement, créant de fausses prévisions d'homologie.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

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Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	51-1	38,9 ko	145,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	51-1	41,3 ko	120,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	51-1	37,7 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
armel	51-1	36,9 ko	107,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	51-1	34,9 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	51-1	39,5 ko	104,0 ko	[liste des fichiers]
i386	51-1	44,5 ko	119,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	49-2	51,1 ko	200,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	51-1	38,1 ko	111,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	51-1	41,2 ko	149,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	51-1	43,3 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	51-1	43,9 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	51-1	40,1 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	51-1	44,5 ko	124,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	51-1	47,7 ko	143,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	51-1	34,5 ko	1 042,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	51-1	41,7 ko	115,0 ko	[liste des fichiers]