Пакет: tantan (49-2)

[ Источник: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Роль: Программа, Область: scope::utility, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к tantan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf]

  библиотека сжатия

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Загрузка tantan

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	41,1 Кб	120,0 Кб	[список файлов]
arm64	37,1 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
armel	36,9 Кб	103,0 Кб	[список файлов]
armhf	34,8 Кб	79,0 Кб	[список файлов]
i386	43,5 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
mips64el	41,1 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	44,0 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
s390x	44,2 Кб	124,0 Кб	[список файлов]