Paket: tantan (51-1 und andere)

[ Quellcode: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

tantan herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	51-1	38,9 kB	145,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	51-1	41,3 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	51-1	37,7 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	51-1	36,9 kB	107,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	51-1	34,9 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	51-1	39,5 kB	104,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	51-1	44,5 kB	119,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	49-2	51,1 kB	200,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	51-1	38,1 kB	111,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	51-1	41,2 kB	149,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	51-1	43,3 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	51-1	43,9 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	51-1	40,1 kB	92,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	51-1	44,5 kB	124,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	51-1	47,7 kB	143,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	51-1	34,5 kB	1.042,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	51-1	41,7 kB	115,0 kB	[Liste der Dateien]