Пакет: tantan (51-1 и други)

[ Източник: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Изтегляне на tantan

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	51-1	38,9 кБ	145,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	51-1	41,3 кБ	120,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	51-1	37,7 кБ	144,0 кБ	[списък на файловете]
armel	51-1	36,9 кБ	107,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	51-1	34,9 кБ	79,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	51-1	39,5 кБ	104,0 кБ	[списък на файловете]
i386	51-1	44,5 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	49-2	51,1 кБ	200,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	51-1	38,1 кБ	111,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	51-1	41,2 кБ	149,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	51-1	43,3 кБ	144,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	51-1	43,9 кБ	144,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	51-1	40,1 кБ	92,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	51-1	44,5 кБ	124,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	51-1	47,7 кБ	143,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	51-1	34,5 кБ	1 042,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	51-1	41,7 кБ	115,0 кБ	[списък на файловете]