Пакет: spaln (3.0.2+dfsg-2 и другие)

[ Источник: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Другие пакеты, относящиеся к spaln

• dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [не hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  библиотека сжатия

Загрузка spaln

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2+b1	527,8 Кб	2 363,0 Кб	[список файлов]
amd64	3.0.2+dfsg-2+b1	567,9 Кб	1 945,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.2+dfsg-2+b1	510,3 Кб	2 231,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	330,7 Кб	799,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2	679,9 Кб	3 602,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	306,2 Кб	811,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.0.2+dfsg-2+b1	541,2 Кб	2 360,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2+b1	566,1 Кб	2 819,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2+b1	573,3 Кб	2 616,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.0.2+dfsg-2+b1	656,4 Кб	3 350,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.0.2+dfsg-2+b1	582,8 Кб	2 061,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	373,7 Кб	713,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2+b1	513,1 Кб	14 484,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	337,2 Кб	813,0 Кб	[список файлов]