套件：spaln（3.0.2+dfsg-2 以及其他的）

[ 原始碼： spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

其他與 spaln 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [除 alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [除 hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [除 hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 spaln

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	3.0.2+dfsg-2+b1	527。8 kB	2，363。0 kB	[檔案列表]
amd64	3.0.2+dfsg-2+b1	567。9 kB	1，945。0 kB	[檔案列表]
arm64	3.0.2+dfsg-2+b1	510。3 kB	2，231。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	2.4.7+dfsg-1	330。7 kB	799。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	3.0.2+dfsg-2	679。9 kB	3，602。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	3.0.2+dfsg-2+b1	504。2 kB	1，845。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	2.4.7+dfsg-1	306。2 kB	811。0 kB	[檔案列表]
mips64el	3.0.2+dfsg-2+b1	541。2 kB	2，360。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	3.0.2+dfsg-2+b1	566。1 kB	2，819。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2+b1	573。3 kB	2，616。0 kB	[檔案列表]
riscv64	3.0.2+dfsg-2+b1	656。4 kB	3，350。0 kB	[檔案列表]
s390x	3.0.2+dfsg-2+b1	582。8 kB	2，061。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	2.4.7+dfsg-1	373。7 kB	713。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	3.0.2+dfsg-2+b1	513。1 kB	14，484。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	2.4.7+dfsg-1	337。2 kB	813。0 kB	[檔案列表]