Пакет: spaln (3.0.2+dfsg-2 и другие)

[ Источник: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Другие пакеты, относящиеся к spaln

• dep: libc6 (>= 2.38) [riscv64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [не riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не riscv64]

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  библиотека сжатия

Загрузка spaln

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3.0.2+dfsg-2+b1	567,9 Кб	1 945,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.2+dfsg-2+b1	510,3 Кб	2 231,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.0.2+dfsg-2+b1	541,2 Кб	2 360,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2+b1	573,3 Кб	2 616,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.0.2+dfsg-2+b1	656,4 Кб	3 350,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.0.2+dfsg-2+b1	582,8 Кб	2 061,0 Кб	[список файлов]