Pakiet: spaln (3.0.2+dfsg-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Inne pakiety związane z spaln

• dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie spaln

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.0.2+dfsg-2+b1	527,8 KiB	2 363,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.0.2+dfsg-2+b1	567,9 KiB	1 945,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.0.2+dfsg-2+b1	510,3 KiB	2 231,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.4.7+dfsg-1	330,7 KiB	799,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3.0.2+dfsg-2	679,9 KiB	3 602,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	3.0.2+dfsg-2+b1	504,2 KiB	1 845,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.4.7+dfsg-1	306,2 KiB	811,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.0.2+dfsg-2+b1	541,2 KiB	2 360,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.0.2+dfsg-2+b1	566,1 KiB	2 819,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2+b1	573,3 KiB	2 616,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.0.2+dfsg-2+b1	656,4 KiB	3 350,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.0.2+dfsg-2+b1	582,8 KiB	2 061,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.4.7+dfsg-1	373,7 KiB	713,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.0.2+dfsg-2+b1	513,1 KiB	14 484,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.4.7+dfsg-1	337,2 KiB	813,0 KiB	[lista plików]