Balík: abyss (2.3.10-1 a iné)

[ Zdroj: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Značky: Pole: Biológia, Implementované v: C, User Interface: Príkazový riadok, Role: Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie ppc64el, riscv64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [nie s390x]

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

  dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [s390x]

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  zdieľaná knižnica SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: make

  nástroj na riadenie kompilácie

• dep: openmpi-bin

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

• dep: openmpi-common

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spoločné súbory

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

Stiahnuť abyss

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2.3.10-1+b1	3,246.5 kB	10,021.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.3.10-1+b1	3,000.6 kB	10,681.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.3.10-1+b1	3,135.6 kB	12,561.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.3.10-1+b1	3,163.1 kB	12,409.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.3.10-1+b1	3,185.2 kB	8,245.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.3.10-1	3,156.1 kB	10,176.0 kB	[zoznam súborov]