Paket: abyss (2.3.10-1 och andra)

[ Källkod: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Märken: Field: Biologi, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Andra paket besläktade med abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej ppc64el, riscv64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Hämta abyss

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.3.10-1+b1	3.246,5 kbyte	10.021,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.3.10-1+b1	3.000,6 kbyte	10.681,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.3.10-1+b1	3.135,6 kbyte	12.561,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.3.10-1+b1	3.163,1 kbyte	12.409,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.3.10-1+b1	3.185,2 kbyte	8.245,0 kbyte	[filförteckning]