Pacote: velvet (1.2.10+dfsg1-9 e outros)

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Fontes externas:

Pagina principal [github.com]

Pacotes similares:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Propósito: Análise

Outros pacotes relacionados a velvet

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [não armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Download de velvet

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	690.5 kB	1,718.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.2.10+dfsg1-9	662.2 kB	1,276.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.2.10+dfsg1-9	642.6 kB	1,399.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.2.10+dfsg1-9	659.7 kB	1,364.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.2.10+dfsg1-9	643.7 kB	1,052.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	694.3 kB	1,473.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.2.10+dfsg1-9	688.9 kB	1,466.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-8	775.3 kB	2,661.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	645.7 kB	1,269.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	610.8 kB	1,217.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.2.10+dfsg1-9	658.0 kB	1,511.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	666.5 kB	1,596.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-9	669.4 kB	1,590.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.2.10+dfsg1-9	700.9 kB	1,332.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.2.10+dfsg1-9	662.4 kB	1,337.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	662.4 kB	1,457.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	664.7 kB	4,671.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	661.8 kB	1,253.0 kB	[lista de arquivos]