Pacote: velvet (1.2.10+dfsg1-8)

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Pacotes similares:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Propósito: Análise

Outros pacotes relacionados a velvet

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Download de velvet

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	658.0 kB	1,256.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	637.2 kB	1,333.0 kB	[lista de arquivos]
armel	655.1 kB	1,459.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	638.3 kB	1,075.0 kB	[lista de arquivos]
i386	685.9 kB	1,453.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	654.7 kB	1,511.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	675.5 kB	1,632.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	667.2 kB	1,589.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	642.5 kB	1,301.0 kB	[lista de arquivos]