Пакунок: velvet (1.2.10+dfsg1-9 and others)

[ Source: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Інші пакунки пов'язані з velvet

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Завантажити velvet

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	690.5 kB	1,718.0 kB	[список файлів]
amd64	1.2.10+dfsg1-9	662.2 kB	1,276.0 kB	[список файлів]
arm64	1.2.10+dfsg1-9	642.6 kB	1,399.0 kB	[список файлів]
armel	1.2.10+dfsg1-9	659.7 kB	1,364.0 kB	[список файлів]
armhf	1.2.10+dfsg1-9	643.7 kB	1,052.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	694.3 kB	1,473.0 kB	[список файлів]
i386	1.2.10+dfsg1-9	688.9 kB	1,466.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-8	775.3 kB	2,661.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	610.8 kB	1,217.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.2.10+dfsg1-9	658.0 kB	1,511.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	666.5 kB	1,596.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-9	669.4 kB	1,590.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.2.10+dfsg1-9	700.9 kB	1,332.0 kB	[список файлів]
s390x	1.2.10+dfsg1-9	662.4 kB	1,337.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	662.4 kB	1,457.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	664.7 kB	4,671.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.2.10+dfsg1-9	661.8 kB	1,253.0 kB	[список файлів]