Pacote: velvet (1.2.10+dfsg1-9)

[ Fonte: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Propósito: Análise

Outros pacotes relacionados a velvet

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [não armel, armhf]

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf]

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Download de velvet

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	662.2 kB	1,276.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	642.6 kB	1,399.0 kB	[lista de arquivos]
armel	659.7 kB	1,364.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	643.7 kB	1,052.0 kB	[lista de arquivos]
i386	688.9 kB	1,466.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	658.0 kB	1,511.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	669.4 kB	1,590.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	700.9 kB	1,332.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	662.4 kB	1,337.0 kB	[lista de arquivos]