Pakiet: velvet (1.2.10+dfsg1-9 i inne)

[ Pakiet źródłowy: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z velvet

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Pobieranie velvet

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	690,5 KiB	1 718,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.2.10+dfsg1-9	662,2 KiB	1 276,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.2.10+dfsg1-9	642,6 KiB	1 399,0 KiB	[lista plików]
armel	1.2.10+dfsg1-9	659,7 KiB	1 364,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.2.10+dfsg1-9	643,7 KiB	1 052,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	694,3 KiB	1 473,0 KiB	[lista plików]
i386	1.2.10+dfsg1-9	688,9 KiB	1 466,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	775,3 KiB	2 661,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	610,8 KiB	1 217,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.2.10+dfsg1-9	658,0 KiB	1 511,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	666,5 KiB	1 596,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-9	669,4 KiB	1 590,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.2.10+dfsg1-9	700,9 KiB	1 332,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.2.10+dfsg1-9	662,4 KiB	1 337,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	662,4 KiB	1 457,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	664,7 KiB	4 671,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-9	661,8 KiB	1 253,0 KiB	[lista plików]