Pacote: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 e outros)

[ Fonte: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Outros pacotes relacionados a tvc

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [ia64]

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg) [não ia64]

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libblas3 [sparc64]

  Implementações de Referências Básicas de Álgebra Linear , Biblioteca compartilhada

  ou libblas.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [ia64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [não ia64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Biblioteca de rotinas de álgebra linear 3 - versão compartilhada

  ou liblapack.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não alpha]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,037.8 kB	3,734.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,088.5 kB	3,505.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	992.7 kB	3,349.0 kB	[lista de arquivos]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	963.5 kB	3,177.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	977.4 kB	2,697.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,016.8 kB	3,219.0 kB	[lista de arquivos]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,117.9 kB	3,544.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,176.5 kB	5,139.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b2	1,021.5 kB	3,333.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	952.2 kB	3,208.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,003.8 kB	3,751.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,056.5 kB	3,870.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,067.7 kB	3,732.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,048.0 kB	2,913.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.0 kB	3,520.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.5 kB	3,088.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	959.0 kB	5,541.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,077.6 kB	3,379.0 kB	[lista de arquivos]