Пакунок: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 and others)

[ Source: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Інші пакунки пов'язані з tvc

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [ia64]

  Технологічна бібліотека лінійної алгебри на C++

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg) [not ia64]

  Технологічна бібліотека лінійної алгебри на C++

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libblas3 [sparc64]

  Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, loong64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [ia64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [not ia64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Бібліотека підпрограм лінійної алгебри вер. 3 — колективна версія

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити tvc

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,037.8 kB	3,734.0 kB	[список файлів]
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,088.5 kB	3,505.0 kB	[список файлів]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	992.7 kB	3,349.0 kB	[список файлів]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	963.5 kB	3,177.0 kB	[список файлів]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	977.4 kB	2,697.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,016.8 kB	3,219.0 kB	[список файлів]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,117.9 kB	3,544.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,176.5 kB	5,139.0 kB	[список файлів]
loong64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b2	1,021.5 kB	3,333.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	952.2 kB	3,208.0 kB	[список файлів]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,003.8 kB	3,751.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,056.5 kB	3,870.0 kB	[список файлів]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,067.7 kB	3,732.0 kB	[список файлів]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,048.0 kB	2,913.0 kB	[список файлів]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.0 kB	3,520.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.5 kB	3,088.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	959.0 kB	5,541.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,077.6 kB	3,379.0 kB	[список файлів]